Uw huidige browser heeft updates nodig. Zolang u niet update zullen bepaalde functionaliteiten op de website niet beschikbaar zijn.
Let op: het geselecteerde rooster heeft overlappende bijeenkomsten.
Volgens onze gegevens heb je nog geen vakken behaald.
Je planning is nog niet opgeslagen
Let op! Uw planning heeft vakken in dezelfde periode met overlappend timeslot
Kwantitatieve biologie (2024/2025: Periode 3)
Cursusdoel
Leerdoelen
Na het volgen van de cursus kun je:
Basiswiskunde
Programmeren in ‘R’
Je werkt in deze cursus aan de volgende vaardigheden:
Na het volgen van de cursus kun je:
Basiswiskunde
- vergelijkingen oplossen, functies schetsen, rekenen met breuken, exponenten, en logaritmen, en kansen berekenen
- gegevens over verschillende typen variabelen correct samenvatten en visualiseren.
- kansen bepalen voor verschillende gangbare kansverdelingen.
- verantwoord schattingen doen aan de hand van steekproeven.
- de onzekerheid in schattingen beoordelen en kwantificeren d.m.v. betrouwbaarheidsintervallen.
- verschillende basale statistische toetsen uitvoeren en de resultaten interpreteren (o.a. t-toetsen, ANOVA).
- controleren of de aannames van een toets geschikt zijn voor de toepassing.
- lineaire relaties tussen variabelen aantonen en interpreteren (correlatie en regressie).
Programmeren in ‘R’
- scripts schrijven om berekeningen uit te voeren.
- datasets van verschillende types manipuleren en visualiseren.
- statistische analyses uitvoeren en de uitvoer interpreteren.
- wiskundige modellen analyseren met behulp van het programma Grind in R.
- uitleggen hoe en waarom modellen inzicht geven in biologische systemen
- voorbeelden geven van belangrijke modeltypes binnen de biologie
- verschillende vormen van populatiegroei omschrijven (o.a. exponentiele-, logistische-, en ruimtelijke groei)
- wiskundige termen in biologisch relevante vergelijkingen herkennen (o.a. geboorte, sterfte, predatie, dichtheidsafhankelijkheid)
- omschrijven wanneer en waarom wiskundige modellen verschillen van ruimtelijke simulaties, en hoe dit biologisch relevante voorspellingen verandert
Je werkt in deze cursus aan de volgende vaardigheden:
- Wiskunde en computersimulaties gebruiken om biologische vragen te beantwoorden.
- Programmeren en analyseren met R.
- Complexe systemen begrijpelijk maken door middel van versimpeling.
- Creatief, kritisch, en procesmatig denken en werken.
| Vaardigheden | Onderdeel van de cursus | Expliciet getoetst? |
| Schrijven | x | x |
| Mondeling presenteren | ||
| Omgaan met data | x | x |
| Praktische onderzoeksvaardigheden | ||
| Onderzoeksvaardigheden | x | x |
| Samenwerken | x | |
| Kritisch denken | x | |
| Loopbaanoriëntatie | ||
| Interdisciplinariteit | x |
Vakinhoudelijk
Ingangseisen
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie.
Studie-interesserichting
Kwantitatieve Biologie is onderdeel van de studie-interesserichting Ecologie en Natuurbeheer, Gedragsbiologie, Evolutiebiologie, Toxicologie en Theoretische Biologie en Bioinformatica en is aanbevolen voor Ontwikkelingsbiologie, Neurobiologie en Microbiologie.
Taal
De voertaal van de cursus is Nederlands, maar bepaalde materialen (literatuur, dictaten, opgaven etc.) kunnen Engels zijn. De vragen bij de deeltoetsen zijn volledig in het Nederlands.
Inhoud
Biologische systemen zijn op elk niveau van nature enorm complex: hun gedrag wordt vaak bepaald door een groot aantal variabelen die elkaar wederzijds beïnvloeden. Daarom wordt bij het bestuderen van biologische systemen en het analyseren van experimentele gegevens vaak gebruik gemaakt van wiskundige en computationele modellen en van statistiek. In deze cursus maak je kennis met deze onderwerpen.
De cursus bestaat uit drie onderdelen:
Basiswiskunde en programmeren in `R'
In de eerste weken van de cursus zijn gericht op basiswiskunde en programmeren in “R”, die voor de rest van het vak (en andere vakken binnen de Bachelor biologie) enorm belangrijk zullen zijn. De basiswiskunde omvat vooral het bijspijkeren van stof van de middelbare school: vergelijkingen oplossen, kansen berekenen, functies tekenen, en rekenen met breuken, exponenten, logaritmen, en limieten.
Statistiek
In het onderdeel Statistiek leer je methoden en technieken voor het verzamelen, bewerken, modelleren, interpreteren en presenteren van gegevens.
Biologische modellering
Dit deel van de cursus gaat over het modelleren van biologische systemen, en het simuleren van modellen met de computer. In dit deel van de cursus behandelen we hoe modellen bijdragen aan het begrijpen van biologische systemen, hoe je modellen moet lezen, en hoe je deze kan simuleren in R. Je zult zien dat we allerlei biologische processen veel beter leren begrijpen als we ze bestuderen met behulp van modellen.
Onderwijsvormen
De stof wordt uitgelegd in Nederlandstalige hoorcolleges, en verdieping vindt plaats tijdens werkcolleges met opgaven op pen en papier of met de computer. Het volgen van deze werkcolleges is onontbeerlijk voor een voldoende begrip van de stof. Zelfstudietijd omvat het doornemen van het studiemateriaal (dictaten, boeken), en het bestuderen van een eventuele kennisclip of een artikel. Tijdens het onderdeel Biologische Modellering voer je een kort project uit, en schrijf je hierover een kort verslag.
Toetsing
De drie onderdelen worden getoetst in individuele deeltoetsen: Basiswiskunde en R (10%), Statistiek (40%), en Biologische Modellering (40%). Het verslag gaat over één van de computerpractica, en telt voor 10% mee.
Eindcijfer
Herkansing
Studiemateriaal
Verplicht:
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie.
Studie-interesserichting
Kwantitatieve Biologie is onderdeel van de studie-interesserichting Ecologie en Natuurbeheer, Gedragsbiologie, Evolutiebiologie, Toxicologie en Theoretische Biologie en Bioinformatica en is aanbevolen voor Ontwikkelingsbiologie, Neurobiologie en Microbiologie.
Taal
De voertaal van de cursus is Nederlands, maar bepaalde materialen (literatuur, dictaten, opgaven etc.) kunnen Engels zijn. De vragen bij de deeltoetsen zijn volledig in het Nederlands.
Inhoud
Biologische systemen zijn op elk niveau van nature enorm complex: hun gedrag wordt vaak bepaald door een groot aantal variabelen die elkaar wederzijds beïnvloeden. Daarom wordt bij het bestuderen van biologische systemen en het analyseren van experimentele gegevens vaak gebruik gemaakt van wiskundige en computationele modellen en van statistiek. In deze cursus maak je kennis met deze onderwerpen.
De cursus bestaat uit drie onderdelen:
Basiswiskunde en programmeren in `R'
In de eerste weken van de cursus zijn gericht op basiswiskunde en programmeren in “R”, die voor de rest van het vak (en andere vakken binnen de Bachelor biologie) enorm belangrijk zullen zijn. De basiswiskunde omvat vooral het bijspijkeren van stof van de middelbare school: vergelijkingen oplossen, kansen berekenen, functies tekenen, en rekenen met breuken, exponenten, logaritmen, en limieten.
Statistiek
In het onderdeel Statistiek leer je methoden en technieken voor het verzamelen, bewerken, modelleren, interpreteren en presenteren van gegevens.
Biologische modellering
Dit deel van de cursus gaat over het modelleren van biologische systemen, en het simuleren van modellen met de computer. In dit deel van de cursus behandelen we hoe modellen bijdragen aan het begrijpen van biologische systemen, hoe je modellen moet lezen, en hoe je deze kan simuleren in R. Je zult zien dat we allerlei biologische processen veel beter leren begrijpen als we ze bestuderen met behulp van modellen.
Onderwijsvormen
De stof wordt uitgelegd in Nederlandstalige hoorcolleges, en verdieping vindt plaats tijdens werkcolleges met opgaven op pen en papier of met de computer. Het volgen van deze werkcolleges is onontbeerlijk voor een voldoende begrip van de stof. Zelfstudietijd omvat het doornemen van het studiemateriaal (dictaten, boeken), en het bestuderen van een eventuele kennisclip of een artikel. Tijdens het onderdeel Biologische Modellering voer je een kort project uit, en schrijf je hierover een kort verslag.
Toetsing
De drie onderdelen worden getoetst in individuele deeltoetsen: Basiswiskunde en R (10%), Statistiek (40%), en Biologische Modellering (40%). Het verslag gaat over één van de computerpractica, en telt voor 10% mee.
Eindcijfer
- Bij aanvang van de cursus wordt precies uitgelegd hoe het eindcijfer wordt berekend.
- Voor de drie toetsen moet minimaal een 5 gehaald worden en het gemiddelde voor deze deelcijfers moet minimaal een 5,5 zijn.
Herkansing
- Van de onderdelen die niet herkanst hoeven of kunnen worden blijft het deeltoetscijfer staan.
- In lijn met de OER mag er alleen herkanst worden als het eindcijfer voor de cursus (deelcijfers en opdrachten samen) tussen de 4,0 en 5,5 is.
Studiemateriaal
Verplicht:
- Voor alle onderdelen worden dictaten of andere (online) materialen tegen kostprijs beschikbaar gesteld.
Werkvormen
Hoorcollege
Hoorcollege 1
Inzage
Practicum
Werkcollege
Hoorcollege 1
Inzage
Practicum
Werkcollege
Toetsing
Eindresultaat
Verplicht | Weging 100% | ECTS 7,5
Ingangseisen en voorkennis
Ingangseisen
Je moet inschreven staan voor de volgende opleiding:
- Biologie
Voorkennis
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie.
Voertalen
- Nederlands
Cursusmomenten
Tentamens
Er is geen tentamenrooster beschikbaar voor deze cursus
Verplicht materiaal
-
WERKBOEKVoor alle onderdelen worden dictaten of andere (online) materialen tegen kostprijs beschikbaar gesteld.Theoretische Biologie een dictaat. Deze zijn gratis te downloaden als PDF of tegen kostprijs als papieren versie aan te schaffen.
Aanbevolen materiaal
Er is geen informatie over de aanbevolen literatuur bekend
Coördinator
| dr. B. van Dijk | b.vandijk@uu.nl |
Docenten
| C.A. Eekhuis MSc | C.A.Eekhuis@uu.nl |
| dr. B. van Dijk | b.vandijk@uu.nl |
| J.B. van Vulpen | j.b.vanvulpen@uu.nl |
| S. de Valck MSc | s.devalck@uu.nl |
| dr. R. Hermsen | r.hermsen@uu.nl |
Inschrijving
Let op: deze cursus is niet toegankelijk voor studenten van andere faculteiten, bijvakkers mogen zich dus niet inschrijven.
Inschrijving
Van maandag 4 november 2024 tot en met vrijdag 22 november 2024
Na-inschrijving
Van maandag 20 januari 2025 tot en met dinsdag 21 januari 2025
Inschrijving niet geopend
Permanente link naar de cursuspagina
Laat in de Cursus-Catalogus zien
klikt, stop je een vak in je rugzak, zodat je dit vak door de rest van de CursusPlanner mee kunt nemen.