Uw huidige browser heeft updates nodig. Zolang u niet update zullen bepaalde functionaliteiten op de website niet beschikbaar zijn.
Let op: het geselecteerde rooster heeft overlappende bijeenkomsten.
Volgens onze gegevens heb je nog geen vakken behaald.
Je planning is nog niet opgeslagen
Let op! Uw planning heeft vakken in dezelfde periode met overlappend timeslot
Biologische Modellen en Statistiek (2026/2027: Periode 3)
Cursusdoel
Leerdoelen
Na het volgen van de cursus kun je:
Basiswiskunde
Programmeren in ‘R’
Biologische modellen
Statistiek
Je werkt in deze cursus aan de volgende vaardigheden:
Na het volgen van de cursus kun je:
Basiswiskunde
- vergelijkingen oplossen en functies schetsen,
- rekenen met breuken, exponenten, logaritmen,
- kansen berekenen
Programmeren in ‘R’
- scripts schrijven om berekeningen uit te voeren.
- datasets van verschillende types manipuleren en visualiseren.
- statistische analyses uitvoeren en de uitvoer interpreteren.
- wiskundige modellen analyseren met behulp van het script grind.R.
Biologische modellen
- uitleggen waarom modellen essentieel zijn binnen de biologische wetenschappen
- voorbeelden geven van verschillende typen modellen, en de verschillende aannames die daarbij komen kijken
- een biologisch vraagstuk koppelen aan een geschikt model
- wiskundige modellen van biologische systemen lezen, begrijpen, en interpreteren, en de biologisch relevante termen herkennen (geboorte, sterfte, predatie, etc.)
- uitleggen hoe een verandering van parameters kan leiden tot fundamenteel ander gedrag van een systeem
- begrijpen waarom voorspellingen van wiskundige modellen kunnen verschillen van voorspellingen in computersimulaties
- uitleggen wat emergente eigenschappen zijn, en voorbeelden geven van modellen met emergente eigenschappen
Statistiek
- Gegevens over verschillende typen variabelen correct samenvatten en visualiseren.
- De basisregels van het kansrekenen toepassen om kansen te berekenen.
- Kansen bepalen voor normale verdelingen en t-verdelingen.
- Kritisch beoordelen wat de gevaren zijn op verschillende soorten bias in schattingen.
- De onzekerheid in schattingen kwantificeren d.m.v. betrouwbaarheidsintervallen.
- Verschillende statistische toetsen uitvoeren (o.a. t-toetsen) en de resultaten, waaronder de P-waarde, correct interpreteren.
- Controleren of het statistische model van een toets geschikt is voor de toepassing.
- Aan de hand van causale diagrammen evalueren of confounders of colliders een rol kunnen spelen bij het ontstaan van associaties tussen variabelen.
- Het belang van controlegroepen uitleggen en bepalen of regression to the mean resultaten kan beïnvloeden.
- Lineaire relaties tussen variabelen aantonen en interpreteren (correlatie en regressie).
- Eenvoudige statistische analyses uitvoeren in R de uitvoer correct interpreteren.
Je werkt in deze cursus aan de volgende vaardigheden:
- Wiskunde en computersimulaties gebruiken om biologische vragen te beantwoorden.
- Programmeren en analyseren met R.
- Complexe systemen begrijpelijk maken door middel van versimpeling.
- Creatief, kritisch, en procesmatig denken en werken.
| Vaardigheden | Onderdeel van de cursus | Expliciet getoetst? |
| Schrijven | x | x |
| Mondeling presenteren | ||
| Omgaan met data | x | x |
| Praktische onderzoeksvaardigheden | ||
| Onderzoeksvaardigheden | x | x |
| Samenwerken | x | x |
| Kritisch denken | x | |
| Loopbaanoriëntatie | ||
| Interdisciplinariteit | x |
Vakinhoudelijk
Ingangseisen
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie. Deze cursus vervangt de voormalige cursus Kwantitatieve Biologie (B-B1KWBI20).
Studie-interesserichting
Biologische modellen en statistiek is onderdeel van de studie-interesserichting Ecologie en Natuurbeheer, Gedragsbiologie, Evolutiebiologie, Toxicologie en Theoretische Biologie en Bioinformatica. Daarnaast is het aanbevolen voor Ontwikkelingsbiologie, Neurobiologie en Microbiologie.
Taal
De voertaal van de cursus is Nederlands. Het meeste materiaal (cursusboek, slides, kennisclips) zijn ook Nederlands, met een enkele uitzondering voor gerefereerde literatuur. De vragen bij de deeltoetsen zijn ook in het Nederlands.
Inhoud
Biologische systemen zijn van nature — op elk niveau — enorm complex: hun gedrag wordt vaak bepaald door een groot aantal variabelen die elkaar wederzijds beïnvloeden. Daarom wordt bij het bestuderen van biologische systemen en het analyseren van experimentele gegevens vaak gebruik gemaakt van wiskundige en computationele modellen en van statistiek. In deze cursus maak je kennis met deze onderwerpen.
De cursus bestaat uit drie onderdelen:
Basiswiskunde en programmeren in `R'
In de eerste weken van de cursus zijn gericht op basiswiskunde en programmeren in “R”, die voor de rest van het vak (en andere vakken binnen de Bachelor biologie) enorm belangrijk zullen zijn. De basiswiskunde omvat vooral het bijspijkeren van stof van de middelbare school: vergelijkingen oplossen, bepalen van afgeleiden, functies schetsen, en rekenen met breuken, exponenten, logaritmen, en limieten.
Biologische modellering
Dit deel van de cursus gaat over het bestuderen van versimpelingen (modellen) van biologische systemen. Deze zullen zowel wiskundig zijn, als in de vorm van computersimulaties. Je leert hoe modellen bijdragen aan het begrijpen van biologische systemen, hoe je modellen moet lezen, en hoe je deze kan doorrekenen in R. Je zult zien dat we allerlei biologische processen veel beter leren begrijpen als we ze bestuderen met behulp van modellen.
Statistiek
In het onderdeel Statistiek leer je methoden en technieken voor het verzamelen, bewerken, modelleren, interpreteren en presenteren van gegevens. Ook leer je kritisch denken, zodat je oorzaak en gevolg kan onderscheiden en zo betrouwbare conclusies kan trekken.
Onderwijsvormen
De stof wordt uitgelegd in Nederlandstalige hoorcolleges, en verdieping vindt plaats tijdens werkcolleges met opgaven op pen en papier of met de computer. Het volgen van deze werkcolleges is onontbeerlijk voor een voldoende begrip van de stof. Zelfstudietijd omvat het doornemen van het studiemateriaal (cursusboek), en het bestuderen van een eventuele kennisclip of een artikel. Tijdens het onderdeel Biologische Modellering voer je een mini-project uit, en schrijf je hierover een kort verslag.
Toetsing
De drie onderdelen worden getoetst in individuele deeltoetsen: Basiswiskunde en R (20%), Statistiek (35%), en Biologische Modellering (35%). Het verslag voor het mini-project telt voor 10% mee.
Eindcijfer
Herkansing
Studiemateriaal
Cursuswebsite:
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie. Deze cursus vervangt de voormalige cursus Kwantitatieve Biologie (B-B1KWBI20).
Studie-interesserichting
Biologische modellen en statistiek is onderdeel van de studie-interesserichting Ecologie en Natuurbeheer, Gedragsbiologie, Evolutiebiologie, Toxicologie en Theoretische Biologie en Bioinformatica. Daarnaast is het aanbevolen voor Ontwikkelingsbiologie, Neurobiologie en Microbiologie.
Taal
De voertaal van de cursus is Nederlands. Het meeste materiaal (cursusboek, slides, kennisclips) zijn ook Nederlands, met een enkele uitzondering voor gerefereerde literatuur. De vragen bij de deeltoetsen zijn ook in het Nederlands.
Inhoud
Biologische systemen zijn van nature — op elk niveau — enorm complex: hun gedrag wordt vaak bepaald door een groot aantal variabelen die elkaar wederzijds beïnvloeden. Daarom wordt bij het bestuderen van biologische systemen en het analyseren van experimentele gegevens vaak gebruik gemaakt van wiskundige en computationele modellen en van statistiek. In deze cursus maak je kennis met deze onderwerpen.
De cursus bestaat uit drie onderdelen:
Basiswiskunde en programmeren in `R'
In de eerste weken van de cursus zijn gericht op basiswiskunde en programmeren in “R”, die voor de rest van het vak (en andere vakken binnen de Bachelor biologie) enorm belangrijk zullen zijn. De basiswiskunde omvat vooral het bijspijkeren van stof van de middelbare school: vergelijkingen oplossen, bepalen van afgeleiden, functies schetsen, en rekenen met breuken, exponenten, logaritmen, en limieten.
Biologische modellering
Dit deel van de cursus gaat over het bestuderen van versimpelingen (modellen) van biologische systemen. Deze zullen zowel wiskundig zijn, als in de vorm van computersimulaties. Je leert hoe modellen bijdragen aan het begrijpen van biologische systemen, hoe je modellen moet lezen, en hoe je deze kan doorrekenen in R. Je zult zien dat we allerlei biologische processen veel beter leren begrijpen als we ze bestuderen met behulp van modellen.
Statistiek
In het onderdeel Statistiek leer je methoden en technieken voor het verzamelen, bewerken, modelleren, interpreteren en presenteren van gegevens. Ook leer je kritisch denken, zodat je oorzaak en gevolg kan onderscheiden en zo betrouwbare conclusies kan trekken.
Onderwijsvormen
De stof wordt uitgelegd in Nederlandstalige hoorcolleges, en verdieping vindt plaats tijdens werkcolleges met opgaven op pen en papier of met de computer. Het volgen van deze werkcolleges is onontbeerlijk voor een voldoende begrip van de stof. Zelfstudietijd omvat het doornemen van het studiemateriaal (cursusboek), en het bestuderen van een eventuele kennisclip of een artikel. Tijdens het onderdeel Biologische Modellering voer je een mini-project uit, en schrijf je hierover een kort verslag.
Toetsing
De drie onderdelen worden getoetst in individuele deeltoetsen: Basiswiskunde en R (20%), Statistiek (35%), en Biologische Modellering (35%). Het verslag voor het mini-project telt voor 10% mee.
Eindcijfer
- Bij aanvang van de cursus wordt precies uitgelegd hoe het eindcijfer wordt berekend.
- Voor de drie deeltoetsen moet minimaal een 5 gehaald worden. Het eindcijfer (inclusief het verslag) minimaal een 5,5 zijn. Als hier niet aan voldaan is dan kunnen één of alle deeltoetsen waarvan het cijfer lager is dan een 5,5 herkanst worden.
Herkansing
- Van de onderdelen die niet herkanst hoeven of kunnen worden blijft het deeltoetscijfer staan.
- De herkansing van deeltoets 1 vindt plaats tijdens deeltoets 2. De overige herkansingen vinden plaats tijdens het reguliere herkansingsmoment later in het jaar.
- In lijn met de OER mag er alleen herkanst worden als het eindcijfer voor de cursus (deelcijfers en opdrachten samen) tussen de 4,0 en 5,5 is.
Studiemateriaal
Cursuswebsite:
- Het cursusboek is volledig online beschikbaar. Hier is ook alle overige cursusinformatie te vinden.
- Een fysiek cursusboek wordt tegen een kostprijs beschikbaar gesteld. Hiervoor ontvangen jullie een aantal weken voor de cursus bericht.
- Voor deze cursus heb je een goed werkende laptop nodig om daarop met Rstudio te werken. We ondersteunen studenten met MacOS en Windows. Werken met Chromebooks, iPads of een andere tablets is mogelijk, maar suboptimaal.
Werkvormen
Hoorcollege
Hoorcollege 1
Inzage
Practicum
Werkcollege
Hoorcollege 1
Inzage
Practicum
Werkcollege
Toetsing
Eindresultaat
Verplicht | Weging 100% | ECTS 7,5
Ingangseisen en voorkennis
Ingangseisen
Je moet inschreven staan voor de volgende opleiding:
- Biologie
Voorkennis
VWO met profiel Natuur en Gezondheid met natuurkunde of Natuur en Techniek met biologie.
Voertalen
- Nederlands
Cursusmomenten
Tentamens
Er is geen tentamenrooster beschikbaar voor deze cursus
Verplicht materiaal
-
WERKBOEKCursuswebsite: Het cursusboek is volledig online beschikbaar. Hier is ook alle overige cursusinformatie te vinden. Fysiek cursusboek: Een fysiek cursusboek wordt tegen een kostprijs beschikbaar gesteld. Hiervoor ontvangen jullie een aantal weken voor de cursus bericht. Laptop: Voor deze cursus heb je een goed werkende laptop nodig om daarop met Rstudio te werken. We ondersteunen studenten met MacOS en Windows. Werken met Chromebooks, iPads of een andere tablets is mogelijk, maar suboptimaal.
Aanbevolen materiaal
Er is geen informatie over de aanbevolen literatuur bekend
Coördinator
| dr. B. van Dijk | B.vanDijk@uu.nl |
Docenten
| C.A. Eekhuis MSc | c.a.eekhuis@uu.nl |
| dr. B. van Dijk | B.vanDijk@uu.nl |
| J.B. van Vulpen MSc | j.b.vanvulpen@uu.nl |
| S. de Valck MSc | s.devalck@uu.nl |
| dr. R. Hermsen | R.Hermsen@uu.nl |
Inschrijving
Let op: deze cursus is niet toegankelijk voor studenten van andere faculteiten, bijvakkers mogen zich dus niet inschrijven.
Naar OSIRIS-inschrijvingen
Permanente link naar de cursuspagina
Laat in de Cursus-Catalogus zien
klikt, stop je een vak in je rugzak, zodat je dit vak door de rest van de CursusPlanner mee kunt nemen.